La Secretaría Académica tiene como finalidad organizar y ejecutar el proceso de matrículas, llevar el registro y control de los aspectos legales de la Institución, diligenciar los libros reglamentarios y documentación legal (calificaciones, matrículas, actas, registro de bachilleres, resoluciones rectorales, inscripción de estudiantes de 5°, 9° y 11° a las pruebas Saber e inscripción de los estudiantes del grado Undécimo al SABER 11), entre otras funciones.